Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EP400Q96L91 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EP400Q96L91 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EP400Q96L91 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms