Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPZA3Q96KX2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPZA3Q96KX2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAPZA3Q96KX2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms