Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKNOX2Q96KN3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKNOX2Q96KN3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms