Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM87BQ96K49 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM87BQ96K49 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms