Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VPS50Q96JG6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VPS50Q96JG6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms