Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms