Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGSM3Q96HU1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms