Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MTERF3Q96E29 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MTERF3Q96E29 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms