Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RMDN1Q96DB5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RMDN1Q96DB5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms