Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
OPTNQ96CV9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
OPTNQ96CV9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms