Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TIFAQ96CG3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms