Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CENPTQ96BT3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CENPTQ96BT3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms