Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC127Q96BQ5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms