Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKD2Q969F2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD2Q969F2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms