Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25Q93038 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25Q93038 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25Q93038 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25Q93038 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF25Q93038 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF25Q93038 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF25Q93038 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF25Q93038 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF25Q93038 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF25Q93038 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF25Q93038 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF25Q93038 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF25Q93038 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF25Q93038 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms