Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEMA4DQ92854 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA4DQ92854 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms