Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EDAQ92838 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDAQ92838 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDAQ92838 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EDAQ92838 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDAQ92838 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDAQ92838 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDAQ92838 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDAQ92838 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDAQ92838 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDAQ92838 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDAQ92838 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDAQ92838 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDAQ92838 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDAQ92838 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDAQ92838 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDAQ92838 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDAQ92838 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDAQ92838 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EDAQ92838 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDAQ92838 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDAQ92838 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDAQ92838 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDAQ92838 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDAQ92838 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EDAQ92838 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EDAQ92838 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
EDAQ92838 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EDAQ92838 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDAQ92838 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDAQ92838 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDAQ92838 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDAQ92838 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDAQ92838 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDAQ92838 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDAQ92838 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EDAQ92838 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDAQ92838 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDAQ92838 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDAQ92838 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDAQ92838 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDAQ92838 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDAQ92838 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDAQ92838 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EDAQ92838 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EDAQ92838 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms