Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L4Q8WXT5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L4Q8WXT5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms