Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC107Q8WV48 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC107Q8WV48 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms