Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ACER1Q8TDN7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms