Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HELQQ8TDG4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms