Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD1Q8NHV4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD1Q8NHV4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms