Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC197Q8NCU1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC197Q8NCU1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms