Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC44

RETREG2, Reticulophagy regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG2Q8NC44 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RETREG2Q8NC44 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RETREG2Q8NC44 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms