Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPC24Q8NBT2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPC24Q8NBT2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPC24Q8NBT2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPC24Q8NBT2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPC24Q8NBT2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPC24Q8NBT2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPC24Q8NBT2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPC24Q8NBT2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPC24Q8NBT2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPC24Q8NBT2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms