Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COLGALT1Q8NBJ5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COLGALT1Q8NBJ5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms