Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00337Q8N6G1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms