Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC33Q8N5R6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC33Q8N5R6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms