Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CA13Q8N1Q1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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CA13Q8N1Q1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CA13Q8N1Q1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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