Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPAP2Q8IXW5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPAP2Q8IXW5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms