Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM139Q8IV31 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM139Q8IV31 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms