Protein–RNA interactions for Protein: Q86WI3

NLRC5, Protein NLRC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC5Q86WI3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRC5Q86WI3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRC5Q86WI3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms