Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAPPC11Q7Z392 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC11Q7Z392 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC11Q7Z392 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC11Q7Z392 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC11Q7Z392 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC11Q7Z392 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAPPC11Q7Z392 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms