Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
STRCQ7RTU9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
STRCQ7RTU9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms