Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP31Q70CQ4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP31Q70CQ4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms