Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAXIP1Q6ZW49 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAXIP1Q6ZW49 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms