Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RFX8Q6ZV50 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RFX8Q6ZV50 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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