Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCBE1Q6UXH8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCBE1Q6UXH8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms