Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DUX4L9Q6RFH8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUX4L9Q6RFH8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms