Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BLOC1S2Q6QNY1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms