Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC174Q6PII3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC174Q6PII3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms