Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RGMBQ6NW40 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGMBQ6NW40 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms