Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SWSAP1Q6NVH7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SWSAP1Q6NVH7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms