Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SDE2Q6IQ49 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SDE2Q6IQ49 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms