Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GRAMD4Q6IC98 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GRAMD4Q6IC98 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms