Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC9A4Q6AI14 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC9A4Q6AI14 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms