Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CARMIL1Q5VZK9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL1Q5VZK9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms