Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF38BQ5VTL8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPF38BQ5VTL8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms