Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01545Q5VT33 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms