Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.6
STRIP1Q5VSL9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRIP1Q5VSL9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms